经颅磁刺激（TMS）的收费编码、金额及医保情况在不同地区不同医院均有所不同，需查询当地的诊疗项目目录。以下是部分省市经颅磁治疗相关收费编码举例：
地方 | 收费项目 | 收费编码 | 收费标准（三甲医院） |
上海 | 经颅重复磁刺激治疗抑郁症 | N30000005 | 110 元/次 |
江苏 | 经颅磁刺激治疗 | 311503011-a | 130 元/次 |
四川 | 经颅重复磁刺激治疗 | LEEZX006 | 88 元/次 |
浙江 | 经颅磁刺激治疗（TMS） | 31150390100 | 60 元/次 |
| 广东 | 经颅重复磁刺激治疗 | 311503011-1 | 125 元/次 |
湖南 | 经颅重复磁刺激治疗 | 310100036 | 110 元/次 |
河南 | 经颅磁刺激治疗 | 340100036 | 60 元/次 |
江西 | 重复经颅磁刺激TMS 治疗 | 311503031 | 83 元/次 |
重庆 | 经颅磁刺激诊断（TMS） | FBC03716 | 121 元/次 |
经颅磁刺激语言功能区定位 | FBC01701 | 96.8 元/次 | |
经颅重复磁刺激治疗 | KBA32701 | 121 元/次 | |
陕西 | 运动诱发电位（磁刺激器） | 310100010b | 110 元/次 |
经颅重复磁刺激治疗 | 310100010c | 120 元/次 | |
新疆 | 经颅重复磁刺激治疗 | 310100036 | 106 元/次 |
青海 | 经颅磁刺激语言功能区定位 | FBC01701 | 60 元/次 |
经颅磁刺激诊断（TMS） | FBC03716 | 未说明 |
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